Robert E. Lee war von 1862 bis zum Ende des Bürgerkriegs der Befehlshaber der Army of Northern Virginia. In dieser Rolle war er wohl der bedeutendste General des Bürgerkriegs. Seine Fähigkeit, das Beste aus seinen Kommandeuren und Männern herauszuholen, ermöglichte es der Konföderation, ihren Widerstand gegen den Norden gegen zunehmende Widrigkeiten aufrechtzuerhalten. Lee war der Hauptbefehlshaber in mehreren Bürgerkriegsschlachten.
Dies war die erste Schlacht, in der General Lee die konföderierten Truppen im Bürgerkrieg anführte und unter Brigadegeneral Albert Rust diente. Er kämpfte gegen Brigadegeneral Joseph Reynolds Schanzen auf dem Cheat Mountain im Westen von Virginia. Der föderale Widerstand war heftig und Lee beendete schließlich den Angriff. Er wurde am 30. Oktober nach Richmond zurückgerufen und erzielte in West-Virginia nur wenige Ergebnisse. Dies war ein Sieg der Union.
Am 1. Juni 1862 erhielt Lee das Kommando über die Armee von Nord-Virginia. Zwischen dem 25. Juni und dem 1. Juli 1862 führte er seine Truppen in sieben Schlachten, die zusammen die Schlachten der sieben Tage genannt wurden.
In der entscheidenden Schlacht der Northern Virginia Campaign konnten die von Lee, Jackson und Longstreet angeführten Truppen einen riesigen Sieg für die Konföderation verbuchen.
Diese Schlacht fand im Rahmen der Maryland-Kampagne statt. Die Unionsarmee konnte Lees Position auf dem South Mountain übernehmen. McClellan versäumte es jedoch, Lees zerstörte Armee am 15. zu verfolgen, was bedeutete, dass Lee Zeit hatte, sich in Sharpsburg neu zu formieren.
McClellan traf sich schließlich am 16. mit Lees Truppen. Der blutigste Schlachttag während des Bürgerkriegs fand am 17. September statt. Die Bundeswehr hatte zahlenmäßig einen gewaltigen Vorteil, doch Lee kämpfte weiter mit all seinen Kräften. Während sich seine Truppen über den Potomac nach Virginia zurückzogen, konnte er den Vormarsch des Bundes zurückhalten. Die Ergebnisse waren nicht schlüssig, obwohl sie für die Unionsarmee von strategischer Bedeutung waren.
Union-Generalmajor Ambrose Burnside versuchte, Fredericksburg einzunehmen. Die Konföderierten besetzten die umliegenden Höhen. Sie haben zahlreiche Angriffe abgewehrt. Burnside beschloss am Ende, sich zurückzuziehen. Dies war ein Sieg der Konföderierten.
Von vielen als Lees größter Sieg angesehen, marschierte er mit seinen Truppen zu den Bundestruppen, die versuchten, die konföderierte Position zu erobern. Die Unionstruppe unter Generalmajor Joseph Hooker beschloss, sich in Chancellorsville zu verteidigen. "Stonewall" Jackson führte seine Truppen gegen die exponierte linke Flanke des Bundes und zermalmte den Feind entscheidend. Am Ende brach die Unionslinie und sie zogen sich zurück. Lee verlor einen seiner fähigsten Generäle, als Jackson durch ein Freundschaftsfeuer getötet wurde. Dies war ein Sieg der Konföderierten.
In der Schlacht von Gettysburg versuchte Lee einen vollständigen Angriff auf die von Generalmajor George Meade angeführten Unionstruppen. Die Kämpfe waren auf beiden Seiten heftig. Die Unionsarmee konnte die Konföderierten jedoch zurückweisen. Dies war ein entscheidender Sieg der Union.
Die Schlacht in der Wildnis war die erste Offensive von General Ulysses S. Grant in Nord-Virginia während der Überlandkampagne. Der Kampf war heftig, aber die Ergebnisse waren nicht schlüssig. Grant zog sich jedoch nicht zurück.
Grant und Meade versuchten, ihren Marsch nach Richmond in der Overland Campaign fortzusetzen, wurden jedoch am Spotsylvania Courthouse angehalten. In den nächsten zwei Wochen kam es zu einer Reihe von Kämpfen, bei denen insgesamt 30.000 Menschen ums Leben kamen. Die Ergebnisse waren nicht schlüssig, aber Grant konnte seinen Marsch nach Richmond fortsetzen.
Die Unionsarmee unter Grant setzte ihren Vormarsch in der Überlandkampagne fort. Sie machten sich auf den Weg nach Cold Harbor. Am 2. Juni befanden sich beide Armeen jedoch auf einem Feld von sieben Meilen. Grant befahl einen Angriff, der zu einer Flucht für seine Männer führte. Schließlich verließ er das Schlachtfeld und näherte sich Richmond durch die weniger gut verteidigte Stadt Petersburg. Dies war ein Sieg der Konföderierten.
Die Unionsarmee überquerte den James River in Deep Bottom, um Richmond zu bedrohen. Sie blieben jedoch erfolglos, da sie von Gegenangriffen der Konföderierten vertrieben wurden. Sie zogen sich schließlich auf die andere Seite des James River zurück.
General Robert E. Lee versuchte im Appomattox Court House, den Unionstruppen zu entkommen und nach Lynchburg zu fahren, wo die Vorräte warteten. Verstärkungen der Union machten dies jedoch unmöglich. Lee ergab sich Grant.