Am 4. Februar 1861 trafen sich Delegierte aus den sieben abgetrennten Staaten (South Carolina, Mississippi, Florida, Alabama, Georgia, Louisiana und Texas) in Montgomery, AL, und gründeten die Konföderierten Staaten von Amerika. Im Laufe des Monats erarbeiteten sie die Verfassung der Konföderierten Staaten, die am 11. März verabschiedet wurde. Dieses Dokument spiegelte die US-Verfassung in vielerlei Hinsicht wider, sah jedoch den ausdrücklichen Schutz der Sklaverei vor und setzte sich für eine stärkere Philosophie der Rechte der Staaten ein. Um die neue Regierung zu leiten, wählte der Konvent Jefferson Davis aus Mississippi als Präsidenten und Alexander Stephens aus Georgia als Vizepräsidenten. Davis, ein mexikanisch-amerikanischer Kriegsveteran, war zuvor US-Senator und Kriegsminister unter Präsident Franklin Pierce. Davis bewegte sich schnell und forderte 100.000 Freiwillige, um die Konföderation zu verteidigen. Er forderte die sofortige Beschlagnahme von Bundesbesitz in den abgetretenen Staaten.
Bei seiner Amtseinführung am 4. März 1861 erklärte Abraham Lincoln, dass die US-Verfassung ein bindender Vertrag sei und die Sezession der Südstaaten keine rechtliche Grundlage habe. Weiter sagte er, dass er nicht die Absicht habe, die Sklaverei dort zu beenden, wo sie bereits existiere, und nicht vorhabe, in den Süden einzudringen. Darüber hinaus erklärte er, er werde keine Maßnahmen ergreifen, die den bewaffneten Aufstand im Süden rechtfertigen würden, sondern bereit sein, Gewalt anzuwenden, um den Besitz von Bundesanlagen in den abgespaltenen Staaten beizubehalten. Ab April 1861 behielten die USA nur noch die Kontrolle über einige wenige Forts im Süden: Fort Pickens in Pensacola (FL) und Fort Sumter in Charleston (SC) sowie Fort Jefferson in Dry Tortugas und Fort Zachary Taylor in Key West (FL).
Kurz nach der Trennung von South Carolina verlegte Major Robert Anderson vom 1. US-Artillerie-Regiment, der Kommandeur der Hafenverteidigung von Charleston, seine Männer von Fort Moultrie in das fast vollständige Fort Sumter, das sich auf einer Sandbank in der Mitte des Hafens befindet. Anderson, ein Liebling von General Winfield Scott, galt als fähiger Offizier und in der Lage, die zunehmenden Spannungen in Charleston zu verhandeln. Unter zunehmend belagerungsähnlichen Bedingungen, zu denen bis Anfang 1861 Streikpostenboote aus South Carolina gehörten, die die Truppen der Union beobachteten, arbeiteten Andersons Männer daran, den Bau des Forts abzuschließen und die Waffen in den Batterien zu platzieren. Nachdem Anderson und die 85 Männer seiner Garnison Anträge der Regierung von South Carolina abgelehnt hatten, das Fort zu räumen, ließen sie sich nieder, um auf Hilfe und Nachschub zu warten. Im Januar 1861 versuchte Präsident Buchanan, das Fort jedoch mit dem Versorgungsschiff wieder zu versorgen, Stern des Westens, wurde von Kanonen vertrieben, die von Kadetten der Zitadelle besetzt waren.
Im März 1861 tobte in der konföderierten Regierung eine Debatte darüber, wie entschlossen sie sein sollten, Forts Sumter und Pickens in Besitz zu nehmen. Davis wollte wie Lincoln die Grenzstaaten nicht verärgern, indem er als Aggressor auftrat. Lincoln teilte dem Gouverneur von South Carolina, Francis W. Pickens, mit, dass er beabsichtige, das Fort neu zu versorgen, versprach jedoch, keine zusätzlichen Männer oder Munition zu schicken. Er gab vor, dass im Falle eines Angriffs auf die Hilfsexpedition Anstrengungen unternommen würden, um die Garnison vollständig zu verstärken. Diese Nachricht wurde an Davis in Montgomery weitergegeben, wo die Entscheidung getroffen wurde, die Kapitulation des Forts zu erzwingen, bevor Lincolns Schiffe eintrafen.
Diese Pflicht fiel an Gen. P.G.T. Beauregard, die von Davis das Kommando über die Belagerung erhalten hatte. Ironischerweise war Beauregard zuvor ein Schützling von Anderson gewesen. Am 11. April sandte Beauregard einen Adjutanten, um die Übergabe des Forts zu fordern. Anderson lehnte ab und weitere Diskussionen nach Mitternacht konnten die Situation nicht lösen. Am 12. April um 4.30 Uhr platzte eine einzelne Mörserrunde über Fort Sumter und signalisierte den anderen Hafenfestungen, das Feuer zu eröffnen. Anderson antwortete erst um 7:00 Uhr, als Kapitän Abner Doubleday den ersten Schuss für die Union abgab. Anderson hatte wenig zu essen und Munition und versuchte, seine Männer zu beschützen und ihre Gefährdung zu begrenzen. Infolgedessen erlaubte er ihnen nur, die unteren, kasematisierten Geschütze des Forts zu benutzen, die nicht positioniert waren, um die anderen Forts im Hafen effektiv zu beschädigen. Die Offiziersquartiere von Fort Sumter wurden Tag und Nacht bombardiert und in Brand gesteckt. Nach einer 34-stündigen Bombardierung und fast erschöpfter Munition entschloss sich Anderson, das Fort zu übergeben.
Als Reaktion auf den Angriff auf Fort Sumter forderte Lincoln 75.000 90-Tage-Freiwillige auf, den Aufstand niederzuschlagen, und befahl der US-Marine, südliche Häfen zu blockieren. Während die nördlichen Staaten bereitwillig Truppen entsandten, zögerten diese Staaten im oberen Süden. Die Staaten Virginia, Arkansas, Tennessee und North Carolina, die nicht bereit waren, gegen andere Südstaatler zu kämpfen, entschieden sich für einen Austritt und schlossen sich der Konföderation an. Als Reaktion darauf wurde die Hauptstadt von Montgomery nach Richmond, VA, verlegt. Am 19. April 1861 trafen die ersten Unionstruppen in Baltimore auf dem Weg nach Washington ein. Während sie von einem Bahnhof zum anderen marschierten, wurden sie von einem pro-südlichen Mob angegriffen. Bei den Unruhen kamen zwölf Zivilisten und vier Soldaten ums Leben. Um die Stadt zu befrieden, Washington zu schützen und dafür zu sorgen, dass Maryland in der Union bleibt, erklärte Lincoln das Kriegsrecht im Staat und entsandte Truppen.
Der Anaconda-Plan wurde vom mexikanisch-amerikanischen Kriegshelden und Kommandeur der US-Armee, Winfield Scott, entworfen und sollte den Konflikt so schnell und unblutig wie möglich beenden. Scott forderte die Blockade der südlichen Häfen und die Einnahme des lebenswichtigen Mississippi, um die Konföderation in zwei Teile zu teilen, und riet von einem direkten Angriff auf Richmond ab. Dieser Ansatz wurde von der Presse und der Öffentlichkeit verspottet, die glaubten, dass ein schneller Marsch gegen die konföderierte Hauptstadt den südlichen Widerstand zum Zusammenbruch bringen würde. Trotz dieser Lächerlichkeit wurden im Verlauf des Krieges in den nächsten vier Jahren viele Elemente des Plans umgesetzt und führten die Union schließlich zum Sieg.
Als sich Truppen in Washington versammelten, ernannte Lincoln Brig. General Irvin McDowell, um sie in der Armee von Northeastern Virginia zu organisieren. Obwohl McDowell über die Unerfahrenheit seiner Männer besorgt war, war er im Juli aufgrund des wachsenden politischen Drucks und des bevorstehenden Ablaufs der Freiwilligeneinsätze gezwungen, nach Süden vorzustoßen. McDowell zog mit 28.500 Mann um und plante, eine konföderierte Armee mit 21.900 Mann unter Beauregard in der Nähe von Manassas Junction anzugreifen. Dies sollte von Generalmajor Robert Patterson unterstützt werden, der gegen eine 8.900 Mann starke konföderierte Truppe marschieren sollte, die von General Joseph Johnston im westlichen Teil des Staates kommandiert wurde.
Als McDowell sich Beauregards Position näherte, suchte er nach einem Weg, seinen Gegner zu überholen. Dies führte am 18. Juli zu einem Gefecht bei Blackburns Ford. Im Westen hatte Patterson es versäumt, Johnstons Männer festzunageln, damit sie Züge besteigen und nach Osten ziehen konnten, um Beauregard zu stärken. Am 21. Juli rückte McDowell vor und griff Beauregard an. Es gelang seinen Truppen, die konföderierte Linie zu durchbrechen und sie zu zwingen, auf ihre Reserven zurückzugreifen. Rallye um Brig. Die Virginia-Brigade von General Thomas J. Jackson, die Konföderierten, stoppten den Rückzug und stellten mit neuen Truppen die Schlacht auf den Kopf, indem sie McDowells Armee in die Flucht zogen und sie nach Washington zwangen. Die Verluste für die Schlacht betrugen 2.896 (460 Tote, 1.124 Verwundete, 1.312 Gefangene) für die Union und 982 (387 Tote, 1.582 Verwundete, 13 Vermisste) für die Konföderierten.