Nach Abschluss der Konferenz von Jalta im Februar 1945 einigten sich die "Großen Drei" der Alliierten, Franklin Roosevelt (USA), Winston Churchill (Großbritannien) und Joseph Stalin (UdSSR) auf ein erneutes Treffen nach dem Sieg in Europa zur Festlegung der Nachkriegsgrenzen. verhandeln Verträge und lösen Probleme im Umgang mit Deutschland. Dieses geplante Treffen sollte ihr drittes Treffen sein, das erste war die Konferenz von Teheran im November 1943. Mit der deutschen Kapitulation am 8. Mai planten die Führer eine Konferenz in der deutschen Stadt Potsdam für Juli.
Am 12. April starb Roosevelt und Vizepräsident Harry S. Truman stieg in die Präsidentschaft auf. Obwohl Truman ein relativer Neuling in der Außenpolitik war, war er Stalins Motiven und Wünschen in Osteuropa gegenüber deutlich misstrauischer als sein Vorgänger. Truman reiste mit Außenminister James Byrnes nach Potsdam ab und hoffte, einige der Zugeständnisse, die Roosevelt Stalin im Namen der Aufrechterhaltung der Einheit der Alliierten während des Krieges gemacht hatte, rückgängig zu machen. Treffen im Schloss Cecilienhof, die Gespräche begannen am 17. Juli. Bei der Konferenzleitung wurde Truman zunächst von Churchills Erfahrung im Umgang mit Stalin unterstützt.
Dies kam am 26. Juli zu einem abrupten Stillstand, als Churchills Konservative Partei bei den Parlamentswahlen 1945 auf erstaunliche Weise besiegt wurde. Die Bekanntgabe der Ergebnisse wurde am 5. Juli verschoben, um die Stimmen der im Ausland dienenden britischen Streitkräfte genau zu zählen. Nach der Niederlage von Churchill wurde der britische Kriegsführer durch den neuen Premierminister Clement Attlee und den neuen Außenminister Ernest Bevin ersetzt. In Ermangelung von Churchills umfassender Erfahrung und seines unabhängigen Geistes schob sich Attlee in den letzten Phasen der Gespräche häufig auf Truman zurück.
Zu Beginn der Konferenz erfuhr Truman vom Trinity Test in New Mexico, der den erfolgreichen Abschluss des Manhattan-Projekts und die Schaffung der ersten Atombombe anzeigte. Er teilte diese Informationen am 24. Juli mit Stalin und hoffte, dass die Existenz der neuen Waffe seine Hand im Umgang mit dem sowjetischen Führer stärken würde. Dieses neue Projekt beeindruckte Stalin nicht, da er durch sein Spionagenetzwerk vom Manhattan-Projekt erfahren hatte und sich dessen Fortschritts bewusst war.
Zu Beginn der Gespräche bestätigten die Staats- und Regierungschefs, dass sowohl Deutschland als auch Österreich in vier Besatzungszonen aufgeteilt werden. Truman drängte darauf, die Forderung der Sowjetunion nach schweren Reparationen aus Deutschland zu mildern. Truman glaubte, dass die durch den Vertrag von Versailles nach dem Ersten Weltkrieg erhobenen schweren Reparationen die deutsche Wirtschaft, die den Aufstieg der Nationalsozialisten anführte, lahmgelegt hatten, und bemühte sich darum, die Reparationen zu begrenzen. Nach umfangreichen Verhandlungen wurde vereinbart, dass die sowjetischen Reparationen auf ihre Besatzungszone sowie auf 10% der überschüssigen Industriekapazität der anderen Zone beschränkt sein sollten.
Die Staats- und Regierungschefs waren sich auch einig, dass Deutschland entmilitarisiert, identifiziert und alle Kriegsverbrecher strafrechtlich verfolgt werden sollten. Um die erste davon zu erreichen, wurden Industrien, die mit der Herstellung von Kriegsmaterial verbunden waren, eliminiert oder mit der neuen deutschen Wirtschaft reduziert, um auf der Landwirtschaft und der einheimischen Produktion zu basieren. Zu den kontroversen Entscheidungen in Potsdam gehörten die polnischen. Im Rahmen der Potsdamer Gespräche einigten sich die USA und Großbritannien darauf, anstelle der seit 1939 in London ansässigen polnischen Exilregierung die von der Sowjetunion unterstützte Provisorische Regierung der nationalen Einheit anzuerkennen.
Darüber hinaus erklärte sich Truman widerstrebend bereit, den sowjetischen Forderungen zuzustimmen, wonach die neue Westgrenze Polens entlang der Oder-Neiße-Linie liegen sollte. Durch die Nutzung dieser Flüsse zur Bezeichnung der neuen Grenze verlor Deutschland fast ein Viertel seines Vorkriegsgebiets, wobei die meisten nach Polen und ein großer Teil Ostpreußens an die Sowjets gingen. Obwohl Bevin gegen die Oder-Neiße-Linie argumentierte, handelte Truman dieses Territorium effektiv, um in der Reparationsfrage Zugeständnisse zu machen. Die Übertragung dieses Territoriums führte zur Vertreibung einer großen Anzahl von ethnischen Deutschen und blieb jahrzehntelang umstritten.
Zusätzlich zu diesen Fragen stimmten die Alliierten auf der Potsdamer Konferenz der Bildung eines Außenministerrates zu, der Friedensverträge mit den ehemaligen deutschen Verbündeten vorbereiten sollte. Die Führer der Alliierten einigten sich auch darauf, das Montreux-Übereinkommen von 1936 zu revidieren, das der Türkei die alleinige Kontrolle über die türkische Straße einräumte, wonach die USA und Großbritannien die österreichische Regierung bestimmen und Österreich keine Reparationen zahlen würde. Die Ergebnisse der Potsdamer Konferenz wurden im Potsdamer Abkommen formell vorgestellt, das am Ende des Treffens am 2. August herausgegeben wurde.
Während der Potsdamer Konferenz am 26. Juli gaben Churchill, Truman und der nationalistische chinesische Führer Chiang Kai-Shek die Potsdamer Erklärung heraus, in der die Bedingungen für die Kapitulation Japans dargelegt wurden. Die Erklärung bekräftigte die Forderung nach bedingungsloser Kapitulation und sah vor, dass die Souveränität Japans auf die Heimatinseln beschränkt, Kriegsverbrecher strafrechtlich verfolgt, die autoritäre Regierung beendet, das Militär entwaffnet und eine Besetzung herbeigeführt werden sollte. Trotz dieser Bedingungen wurde auch betont, dass die Alliierten nicht bestrebt waren, die Japaner als Volk zu zerstören.
Japan lehnte diese Bedingungen trotz der Drohung der Alliierten ab, dass "sofortige und völlige Zerstörung" eintreten würde. Als Reaktion auf die Japaner befahl Truman, die Atombombe einzusetzen. Der Einsatz der neuen Waffe auf Hiroshima (6. August) und Nagasaki (9. August) führte schließlich zur Kapitulation Japans am 2. September. Die alliierten Führer, die Potsdam verließen, würden sich nicht wieder treffen. Das während der Konferenz einsetzende Überfrieren der amerikanisch-sowjetischen Beziehungen eskalierte schließlich im Kalten Krieg.