Atahualpa war der letzte der einheimischen Herren des mächtigen Inka-Reiches, das Teile des heutigen Perus, Chiles, Ecuadors, Boliviens und Kolumbiens überspannte. Er hatte gerade seinen Bruder Huascar in einem gewaltsamen Bürgerkrieg besiegt, als spanische Eroberer, angeführt von Francisco Pizarro, in die Anden kamen. Der unglückliche Atahualpa wurde schnell von den Spaniern gefangen genommen und als Lösegeld gehalten. Obwohl sein Lösegeld bezahlt wurde, töteten ihn die Spanier trotzdem und machten den Weg frei für die Plünderung der Anden.
Im Inka-Reich bedeutete das Wort "Inka" "König" und bezog sich im Allgemeinen nur auf einen Mann: den Herrscher des Reiches. Atahualpa war einer von vielen Söhnen von Inca Huayna Capac, einem effizienten und ehrgeizigen Herrscher. Die Inkas konnten nur ihre Schwestern heiraten, sonst galt niemand als edel genug. Sie hatten jedoch viele Konkubinen und ihre Nachkommen (einschließlich Atahualpa) galten als regierungsfähig. Die Herrschaft über die Inka ging nicht unbedingt zuerst auf den ältesten Sohn über, wie es die europäische Tradition war. Jeder Sohn von Huayna Capac wäre akzeptabel. Oft brachen Bürgerkriege zwischen Brüdern aus, um die Nachfolge anzustreben.
Huayna Capac starb 1526 oder 1527, möglicherweise an einer europäischen Infektion wie Pocken. Sein scheinbarer Erbe Ninan Cuyuchi starb ebenfalls. Das Imperium spaltete sich sofort, als Atahualpa den nördlichen Teil von Quito und sein Bruder Huascar den südlichen Teil von Cuzco aus regierte. Ein erbitterter Bürgerkrieg folgte und tobte, bis Huascar 1532 von Atahualpas Streitkräften erobert wurde. Obwohl Huascar erobert worden war, war das Misstrauen der Region nach wie vor hoch und die Bevölkerung war klar gespalten. Keine Fraktion wusste, dass sich eine weitaus größere Bedrohung von der Küste her näherte.
Francisco Pizarro war ein erfahrener Aktivist, der sich von Hernán Cortés 'kühner (und lukrativer) Eroberung Mexikos inspirieren ließ. 1532 brach Pizarro mit 160 Spaniern an der Westküste Südamerikas auf, um ein ähnliches Reich zu erobern und zu plündern. Die Truppe bestand aus vier Brüdern Pizarros. Diego de Almagro war ebenfalls beteiligt und würde nach Atahualpas Eroberung mit Verstärkung eintreffen. Die Spanier hatten einen enormen Vorteil gegenüber den Anden mit ihren Pferden, Rüstungen und Waffen. Sie hatten einige Dolmetscher, die zuvor von einem Handelsschiff erbeutet worden waren.
Die Spanier hatten das große Glück, dass sich Atahualpa zufällig in Cajamarca befand, einer der küstennahen Großstädte, in der sie ausgestiegen waren. Atahualpa hatte gerade die Nachricht erhalten, dass Huascar gefangen genommen worden war und mit einer seiner Armeen feierte. Er hatte von den Ausländern gehört und das Gefühl, von weniger als 200 Fremden wenig zu befürchten zu haben. Die Spanier versteckten ihre Reiter in den Gebäuden rund um den Hauptplatz von Cajamarca, und als die Inka kamen, um sich mit Pizarro zu unterhalten, ritten sie hinaus, schlachteten Hunderte und nahmen Atahualpa gefangen. Es wurden keine Spanier getötet.
Als Atahualpa gefangen gehalten wurde, war das Imperium gelähmt. Atahualpa hatte ausgezeichnete Generäle, aber keiner wagte es, ihn zu befreien. Atahualpa war sehr intelligent und erfuhr bald von der spanischen Liebe zu Gold und Silber. Für seine Freilassung bot er an, einen großen Raum halb mit Gold und zweimal mit Silber zu füllen. Die Spanier waren sich schnell einig und das Gold floss aus allen Winkeln der Anden herein. Das meiste davon war in Form von unbezahlbarer Kunst und alles war eingeschmolzen, was zu einem unkalkulierbaren kulturellen Verlust führte. Einige der gierigen Konquistadoren machten sich daran, goldene Gegenstände zu zerbrechen, damit der Raum länger füllen würde.
Vor der Ankunft der Spanier hatte sich Atahualpa bei seinem Aufstieg zur Macht als unbarmherzig erwiesen. Er befahl den Tod seines Bruders Huascar und mehrerer anderer Familienmitglieder, die ihm den Weg zum Thron versperrten. Der Spanier, der mehrere Monate lang Atahualpas Entführer war, fand ihn mutig, intelligent und witzig. Er akzeptierte seine Inhaftierung stoisch und regierte sein Volk weiter, während er gefangen war. Er hatte von einigen seiner Konkubinen kleine Kinder in Quito, und er war offensichtlich ziemlich an sie gebunden. Als die Spanier beschlossen, Atahualpa hinzurichten, sträubten sich einige dagegen, weil sie ihn liebgewonnen hatten.
Obwohl Atahualpa mit einigen einzelnen Spaniern wie Francisco Pizarros Bruder Hernando befreundet gewesen sein mag, wollte er sie aus seinem Königreich verbannen. Er sagte seinen Leuten, sie sollten keine Rettungsversuche unternehmen und glaubten, die Spanier würden gehen, sobald sie ihr Lösegeld erhalten hätten. Die Spanier wussten, dass ihr Gefangener das Einzige war, was Atahualpas Armeen davon abhielt, auf sie herabzustürzen. Atahualpa hatte drei wichtige Generäle, von denen jeder eine Armee befehligte: Chalcuchima in Jauja, Quisquis in Cuzco und Rumiñahui in Quito.
General Chalcuchima ließ sich nach Cajamarca locken und gefangen nehmen, aber die beiden anderen blieben für Pizarro und seine Männer eine Bedrohung. Im Juli 1533 hörten sie Gerüchte, dass Rumiñahui sich mit einer mächtigen Armee näherte, die vom gefangenen Kaiser gerufen wurde, um die Eindringlinge auszurotten. Pizarro und seine Männer gerieten in Panik. Sie beschuldigten Atahualpa des Verrats und verurteilten ihn, auf dem Scheiterhaufen zu brennen, obwohl er irgendwann in die Garnison geriet. Atahualpa starb am 26. Juli 1533 in Cajamarca. Rumiñahuis Armee kam nie: Die Gerüchte waren falsch gewesen.
Als Atahualpa tot war, bestiegen die Spanier seinen Bruder Tupac Huallpa schnell auf den Thron. Obwohl Tupac Huallpa bald an Pocken starb, gehörte er zu einer Reihe von Marionetten-Inkas, die es den Spaniern erlaubten, die Nation zu kontrollieren. Als Atahualpas Neffe Túpac Amaru 1572 getötet wurde, starb die königliche Inka-Linie mit ihm und beendete für immer jede Hoffnung auf einheimische Herrschaft in den Anden.
Die erfolgreiche Eroberung des Inka-Reiches durch die Spanier beruhte größtenteils auf unglaublichem Glück und einigen Schlüsselfehlern der Anden. Wären die Spanier ein oder zwei Jahre später angekommen, hätte der ehrgeizige Atahualpa seine Macht gefestigt und die Bedrohung durch die Spanier möglicherweise ernster genommen und sich nicht so leicht einfangen lassen. Der nach dem Bürgerkrieg anhaltende Hass der Bevölkerung von Cuzco auf Atahualpa trug sicherlich auch zu seinem Untergang bei.
Nach Atahualpas Tod begannen einige Leute in Spanien unbehagliche Fragen zu stellen, ob Pizarro das Recht habe, in Peru einzudringen und Atahualpa zu erobern, da Atahualpa ihm nie Schaden zugefügt hatte. Diese Fragen wurden schließlich gelöst, indem erklärt wurde, dass Atahualpa, der jünger war als sein Bruder Huáscar, mit dem er sich gestritten hatte, den Thron an sich gerissen hatte. Daher wurde argumentiert, er sei faires Spiel. Dieses Argument war sehr schwach - es war den Inkas egal, wer älter war, jeder Sohn von Huayna Capac hätte König sein können -, aber es reichte aus. Bis 1572 gab es eine vollständige Abstrichkampagne gegen Atahualpa, der als grausamer Tyrann und Schlimmeres galt. Die Spanier hätten das Andenvolk vor diesem "Dämon" "gerettet".