Die "Neuen Gesetze" von 1542 waren eine Reihe von Gesetzen und Verordnungen, die der spanische König im November 1542 verabschiedete, um die Spanier zu regulieren, die die Ureinwohner in Amerika, insbesondere in Peru, versklaven. Die Gesetze waren in der Neuen Welt äußerst unpopulär und führten unmittelbar zu einem Bürgerkrieg in Peru. Die Aufregung war so groß, dass König Charles schließlich gezwungen war, viele der unbeliebteren Aspekte der neuen Gesetzgebung außer Kraft zu setzen, weil er befürchtete, seine neuen Kolonien gänzlich zu verlieren.
Das Amerika wurde 1492 von Christoph Kolumbus entdeckt: Ein päpstlicher Bulle teilte 1493 das neu entdeckte Land zwischen Spanien und Portugal auf. Siedler, Entdecker und Eroberer aller Art machten sich sofort auf den Weg in die Kolonien, wo sie die Eingeborenen zu Tausenden folterten und töteten, um ihr Land und ihren Reichtum einzunehmen. Im Jahr 1519 eroberte Hernan Cortes das Aztekenreich in Mexiko: Etwa fünfzehn Jahre später besiegte Francisco Pizarro das Inka-Reich in Peru. Diese einheimischen Reiche hatten viel Gold und Silber und die Männer, die daran teilnahmen, wurden sehr reich. Dies wiederum inspirierte immer mehr Abenteurer, nach Amerika zu kommen, in der Hoffnung, an der nächsten Expedition teilzunehmen, die ein einheimisches Königreich erobern und plündern würde.
Mit den großen einheimischen Imperien in Mexiko und Peru mussten die Spanier ein neues Regierungssystem aufbauen. Die erfolgreichen Eroberer und Kolonialbeamten nutzten die Encomienda System. Im Rahmen des Systems wurde einer Person oder Familie Land gegeben, auf dem im Allgemeinen bereits Einheimische lebten. Eine Art "Deal" wurde impliziert: Der neue Besitzer war für die Eingeborenen verantwortlich: Er würde sich um ihre Unterweisung im Christentum, ihre Ausbildung und ihre Sicherheit kümmern. Im Gegenzug lieferten die Eingeborenen Nahrungsmittel, Gold, Mineralien, Holz oder andere wertvolle Güter, die aus dem Land gewonnen werden konnten. Die Gebiete der Encomienda gingen von einer Generation zur nächsten und ermöglichten es den Familien der Eroberer, sich wie ein lokaler Adliger niederzulassen. In Wirklichkeit war das Encomienda-System nicht viel mehr als Sklaverei unter einem anderen Namen: Die Eingeborenen wurden gezwungen, auf Feldern und in Minen zu arbeiten, oft bis sie buchstäblich tot umfielen.
Einige widersetzten sich den schrecklichen Übergriffen der einheimischen Bevölkerung. Bereits 1511 fragte ein Mönch namens Antonio de Montesinos in Santo Domingo die Spanier, mit welchem Recht sie in ein Volk eingedrungen, dieses versklavt, vergewaltigt und ausgeraubt hätten, das ihnen keinen Schaden zugefügt hatte. Bartolomé de Las Casas, ein Dominikaner, begann die gleichen Fragen zu stellen. Las Casas, ein einflussreicher Mann, hatte das Ohr des Königs und erzählte vom unnötigen Tod von Millionen von Indern, die immerhin spanische Untertanen waren. Las Casas war ziemlich überzeugend und König Karl von Spanien beschloss schließlich, etwas gegen die Morde und Folterungen zu unternehmen, die in seinem Namen durchgeführt wurden.
Die "neuen Gesetze", wie die Gesetzgebung bekannt wurde, sorgten für tiefgreifende Veränderungen in den spanischen Kolonien. Die Eingeborenen sollten als frei betrachtet werden, und die Besitzer der Encomiendas konnten von ihnen keine freien Arbeitskräfte oder Dienstleistungen mehr fordern. Sie mussten eine gewisse Menge Tribut zahlen, aber für jede zusätzliche Arbeit musste bezahlt werden. Einheimische sollten fair behandelt und mit erweiterten Rechten ausgestattet werden. Encomiendas, die Angehörigen der Kolonialbürokratie oder des Klerus gewährt wurden, sollten unverzüglich an die Krone zurückgegeben werden. Die Klauseln der Neuen Gesetze, die die spanischen Kolonisten am meisten beunruhigten, waren diejenigen, die den Verlust von Encomiendas oder einheimischen Arbeitern durch diejenigen erklärten, die an Bürgerkriegen teilgenommen hatten (das waren fast alle Spanier in Peru), und eine Bestimmung, die Encomiendas nicht erblich machte : Alle Encomiendas würden nach dem Tod des jetzigen Inhabers zur Krone zurückkehren.
Die Reaktion auf die neuen Gesetze war schnell und drastisch: In ganz Spanien waren die Eroberer und Siedler aufgebracht. Blasco Nuñez Vela, der spanische Vizekönig, kam Anfang 1544 in die Neue Welt und kündigte an, die neuen Gesetze durchzusetzen. In Peru, wo die ehemaligen Eroberer am meisten zu verlieren hatten, sammelten sich die Siedler hinter Gonzalo Pizarro, dem letzten der Pizarro-Brüder (Juan und Francisco starben und Hernando Pizarro lebte noch, war aber in Spanien im Gefängnis). Pizarro stellte eine Armee auf und erklärte, dass er die Rechte verteidigen würde, für die er und so viele andere so hart gekämpft hatten. In der Schlacht von Añaquito im Januar 1546 besiegte Pizarro den in der Schlacht gefallenen Vizekönig Núñez Vela. Später besiegte eine Armee unter Pedro de la Gasca im April 1548 Pizarro: Pizarro wurde hingerichtet.
Pizarros Revolution wurde niedergeschlagen, aber der Aufstand hatte dem König von Spanien gezeigt, dass die Spanier in der Neuen Welt (und insbesondere Peru) es ernst meinten, ihre Interessen zu schützen. Obwohl der König moralisch der Meinung war, dass die neuen Gesetze das Richtige waren, befürchtete er, dass Peru sich zu einem unabhängigen Königreich erklären würde (viele von Pizarros Anhängern hatten ihn dazu aufgefordert). Charles hörte seinen Beratern zu, die ihm sagten, dass er die neuen Gesetze besser ernsthaft abschwächen sollte, oder er riskierte, Teile seines neuen Reiches zu verlieren. Die neuen Gesetze wurden aufgehoben und eine verwässerte Version wurde 1552 verabschiedet.
Die Spanier hatten in Amerika eine gemischte Bilanz als Kolonialmacht. Die schrecklichsten Missbräuche ereigneten sich in den Kolonien: Einheimische wurden bei der Eroberung und zu Beginn der Kolonialzeit versklavt, ermordet, gefoltert und vergewaltigt und später von der Macht ausgeschlossen. Einzelne Grausamkeiten sind zu zahlreich und schrecklich, um sie hier aufzulisten. Konquistadoren wie Pedro de Alvarado und Ambrosius Ehinger erreichten Grausamkeitsniveaus, die für moderne Gefühle kaum vorstellbar sind.
So schrecklich die Spanier auch waren, unter ihnen befanden sich einige erleuchtete Seelen wie Bartolomé de Las Casas und Antonio de Montesinos. Diese Männer kämpften fleißig für die Rechte der Ureinwohner in Spanien. Las Casas produzierte Bücher über spanische Übergriffe und war nicht schüchtern, mächtige Männer in den Kolonien anzuprangern. König Karl I. von Spanien hatte, wie Ferdinand und Isabela vor ihm und Philipp II. Nach ihm, sein Herz am richtigen Ort: Alle diese spanischen Herrscher forderten eine faire Behandlung der Eingeborenen. In der Praxis war es jedoch schwierig, den guten Willen des Königs durchzusetzen. Es gab auch einen inhärenten Konflikt: Der König wollte, dass seine einheimischen Untertanen glücklich waren, aber die spanische Krone wurde immer abhängiger von dem stetigen Fluss von Gold und Silber aus den Kolonien, von denen ein Großteil durch Sklavenarbeit in den Minen erzeugt wurde.
Die neuen Gesetze markierten einen wichtigen Wandel in der spanischen Politik. Das Zeitalter der Eroberung war vorbei: Bürokraten, nicht Eroberer, würden die Macht auf dem amerikanischen Kontinent behalten. Die Konquistadoren ihrer Encomiendas zu berauben bedeutete, die aufkeimende adlige Klasse im Keim ersticken zu lassen. Obwohl König Charles die neuen Gesetze außer Kraft setzte, hatte er andere Mittel, um die mächtige Elite der Neuen Welt zu schwächen, und innerhalb einer oder zwei Generationen waren die meisten Encomiendas sowieso in die Krone zurückgekehrt.