Der Tausend-Tage-Krieg war ein Bürgerkrieg, der zwischen 1899 und 1902 in Kolumbien ausgetragen wurde. Der grundlegende Konflikt hinter dem Krieg war der Konflikt zwischen Liberalen und Konservativen, es war also ein ideologischer Krieg im Gegensatz zu einem regionalen, und er war geteilt Familien und wurde im ganzen Land gekämpft. Nachdem ungefähr 100.000 Kolumbianer gestorben waren, forderten beide Seiten die Einstellung der Kämpfe.
Bis 1899 hatte Kolumbien eine lange Tradition von Konflikten zwischen Liberalen und Konservativen. Die grundlegenden Themen waren folgende: Die Konservativen befürworteten eine starke Zentralregierung, begrenzte Stimmrechte und enge Verbindungen zwischen Kirche und Staat. Die Liberalen hingegen befürworteten stärkere Regionalregierungen, ein universelles Wahlrecht und eine Trennung von Kirche und Staat. Die beiden Fraktionen waren seit der Auflösung von Gran Colombia im Jahr 1831 uneins.
1898 wurde der konservative Manuel Antonio Sanclemente zum Präsidenten Kolumbiens gewählt. Die Liberalen waren empört, weil sie glaubten, dass bedeutender Wahlbetrug stattgefunden hatte. Sanclemente, der weit über achtzig Jahre alt war, hatte sich 1861 an einem konservativen Sturz der Regierung beteiligt und war unter Liberalen äußerst unbeliebt. Aufgrund von Gesundheitsproblemen war Sanclementes Einfluss auf die Macht nicht sehr fest und liberale Generäle planten einen Aufstand für Oktober 1899.
Der liberale Aufstand begann in der Provinz Santander. Der erste Zusammenstoß fand statt, als liberale Kräfte im November 1899 versuchten, Bucaramanga einzunehmen, aber zurückgeschlagen wurden. Einen Monat später feierten die Liberalen den größten Sieg des Krieges, als General Rafael Uribe Uribe in der Schlacht von Peralonso eine größere konservative Truppe anführte. Der Sieg bei Peralonso gab den Liberalen die Hoffnung und Kraft, den Konflikt noch zwei Jahre lang gegen überlegene Zahlen auszutragen.
Der liberale General Vargas Santos lehnte es törichterweise ab, seinen Vorteil auszunutzen, und blieb lange genug stehen, damit die Konservativen sich erholen und eine Armee nach ihm schicken konnten. Sie stießen im Mai 1900 in Palonegro im Departement Santander zusammen. Der Kampf war brutal. Es dauerte ungefähr zwei Wochen, was bedeutete, dass die Zersetzung von Körpern zu einem beiderseitigen Faktor wurde. Unterdrückende Hitze und mangelnde medizinische Versorgung machten das Schlachtfeld zur Hölle, als die beiden Armeen immer wieder über die gleiche Strecke von Schützengräben kämpften. Als sich der Rauch verzog, gab es fast 4.000 Tote und die liberale Armee war gebrochen.
Bis zu diesem Zeitpunkt hatten die Liberalen Hilfe aus dem benachbarten Venezuela erhalten. Die Regierung des venezolanischen Präsidenten Cipriano Castro hatte Männer und Waffen geschickt, um auf der liberalen Seite zu kämpfen. Der verheerende Verlust in Palonegro ließ ihn eine Zeit lang jegliche Unterstützung einstellen, obwohl ihn ein Besuch des liberalen Generals Rafael Uribe Uribe davon überzeugt hatte, die Entsendung von Hilfsgütern fortzusetzen.
Nach der Flucht in Palonegro war die Niederlage der Liberalen nur eine Frage der Zeit. Ihre Armeen in Trümmern, würden sie sich auf den Rest des Krieges auf Guerilla-Taktiken verlassen. Es gelang ihnen, einige Siege im heutigen Panama zu erringen, darunter eine kleine Seeschlacht, bei der das Kanonenboot Padilla das chilenische Schiff Lautaro im Hafen von Panama City versenkte. Trotz dieser kleinen Siege konnten selbst Verstärkungen aus Venezuela die liberale Sache nicht retten. Nach der Schlachtung in Peralonso und Palonegro hatten die Menschen in Kolumbien den Wunsch verloren, die Kämpfe fortzusetzen.
Gemäßigte Liberale hatten seit einiger Zeit versucht, ein friedliches Ende des Krieges herbeizuführen. Obwohl ihre Sache verloren ging, weigerten sie sich, eine bedingungslose Kapitulation in Betracht zu ziehen: Sie wollten eine liberale Vertretung in der Regierung als Mindestpreis für die Beendigung der Feindseligkeiten. Die Konservativen wussten, wie schwach die liberale Position in ihren Forderungen war und blieb. Der am 24. Oktober 1902 unterzeichnete Vertrag von Neerlandia war im Grunde genommen ein Waffenstillstandsabkommen, das die Entwaffnung aller liberalen Kräfte beinhaltete. Der Krieg wurde offiziell am 21. November 1902 beendet, als ein zweiter Vertrag auf dem Deck des US-Kriegsschiffes Wisconsin unterzeichnet wurde.
Der Tausend-Tage-Krieg hat die langjährigen Differenzen zwischen den Liberalen und den Konservativen, die in den 1940er Jahren in dem Konflikt, der als bekannt ist, erneut in den Krieg ziehen würden, nicht gemildert La Violencia. Obwohl nominell ein konservativer Sieg, gab es keine wirklichen Gewinner, nur Verlierer. Die Verlierer waren die Menschen in Kolumbien, da Tausende von Menschenleben verloren gingen und das Land verwüstet wurde. Als zusätzliche Beleidigung erlaubte das durch den Krieg verursachte Chaos den Vereinigten Staaten, die Unabhängigkeit Panamas herbeizuführen, und Kolumbien verlor dieses wertvolle Territorium für immer.
Der Tausend-Tage-Krieg ist in Kolumbien als wichtiges historisches Ereignis bekannt, wurde jedoch aufgrund eines außergewöhnlichen Romans international bekannt. Nobelpreisträger Gabriel García Márquez 'Meisterwerk von 1967 Hundert Jahre Einsamkeit deckt ein Jahrhundert im Leben einer fiktiven kolumbianischen Familie ab. Eine der berühmtesten Figuren dieses Romans ist Oberst Aureliano Buendía, der die winzige Stadt Macondo verlässt, um im Tausend-Tage-Krieg jahrelang zu kämpfen (er kämpfte laut dem Protokoll für die Liberalen und es wird angenommen, dass er sich nur auf diese Gedanken stützt) Rafael Uribe Uribe).