Lysander war einer der Heraclidae in Sparta, aber kein Mitglied der königlichen Familien. Über sein frühes Leben ist nicht viel bekannt. Seine Familie war nicht reich, und wir wissen nicht, wie Lysander mit militärischen Befehlen betraut wurde.
Als Alcibiades gegen Ende des Peloponnesischen Krieges zur athenischen Seite zurückkehrte, wurde Lysander mit der Leitung der spartanischen Flotte in der Ägäis betraut, die ihren Sitz in Ephesus hatte (407). Es war Lysanders Dekret, das die Handelsschifffahrt in Ephesus einführte, und seine Gründung von Werften dort, die ihren Aufstieg zum Wohlstand begannen.
Lysander überredete Cyrus, den Sohn des Großen Königs, den Spartanern zu helfen. Als Lysander ging, wollte Cyrus ihm ein Geschenk machen, und Lysander bat Cyrus, eine Erhöhung des Seemannsgehalts zu finanzieren, wodurch Seeleute, die in der Athener Flotte dienten, veranlasst wurden, zur höher bezahlten spartanischen Flotte überzugehen.
Während Alcibiades fort war, provozierte sein Leutnant Antiochus Lysander zu einer Seeschlacht, die Lysander gewann. Die Athener entfernten daraufhin Alcibiades von seinem Kommando.
Lysander gewann Partisanen für Sparta in den Städten, die Athen unterworfen waren, indem er versprach, Dekemvirate einzusetzen und die Interessen potenziell nützlicher Verbündeter bei ihren Bürgern zu fördern. Als die Spartaner Callicratides als Nachfolger von Lysander auswählten, untergrub Lysander seine Position, indem er die Mittel für die Erhöhung der Rückzahlung an Cyrus übermittelte und die Flotte mit auf den Peloponnes zurückbrachte.
Als Callicratides nach der Schlacht von Arginusae (406) starb, forderten Spartas Verbündete, Lysander wieder zum Admiral zu machen. Dies verstieß gegen das spartanische Gesetz, weshalb Aracus zum Admiral ernannt wurde, mit Lysander als seinem Stellvertreter im Namen, aber dem eigentlichen Kommandeur.
Es war Lysander, der für die endgültige Niederlage der athenischen Marine bei Aegospotami verantwortlich war und damit den Peloponnesischen Krieg beendete. Er schloss sich den spartanischen Königen Agis und Pausanias in Attika an. Als Athen nach der Belagerung endgültig unterging, setzte Lysander eine 30-köpfige Regierung ein, die später als 30-köpfige Tyrannen bezeichnet wurde (404)..
Lysanders Werbung für die Interessen seiner Freunde und seine Rachsucht gegen diejenigen, die ihn missfielen, machte ihn in ganz Griechenland unbeliebt. Als der persische Satrap Pharnabazus sich beschwerte, erinnerten sich die spartanischen Ephoren an Lysander. In Sparta selbst kam es zu einem Machtkampf, bei dem die Könige demokratischere Regime in Griechenland befürworteten, um Lysanders Einfluss zu verringern.
Nach dem Tod von König Agis war Lysander maßgeblich daran beteiligt, dass Agis 'Bruder Agesilaus zum König ernannt wurde, anstelle von Leontychides, der im Volksmund eher der Sohn von Alcibiades als dessen König sein sollte. Lysander überredete Agesilaus, eine Expedition nach Asien zu unternehmen, um Persien anzugreifen, aber als sie in den griechisch-asiatischen Städten ankamen, wurde Agesilaus neidisch auf die Aufmerksamkeit, die er Lysander schenkte, und tat alles, um Lysanders Position zu untergraben. Lysander fand sich dort unerwünscht wieder und kehrte nach Sparta (396) zurück, wo er möglicherweise eine Verschwörung gestartet hatte oder nicht, um das Königtum unter allen Herakliden oder möglicherweise allen Spartiaten zur Wahl zu stellen, anstatt es auf die königlichen Familien zu beschränken.
Zwischen Sparta und Theben brach 395 ein Krieg aus, und Lysander wurde getötet, als seine Truppen von einem thebanischen Hinterhalt überrascht wurden.