Evolution ist die Veränderung der Arten im Laufe der Zeit. Bei der Funktionsweise von Ökosystemen auf der Erde haben jedoch viele Arten eine enge und wichtige Beziehung zueinander, um ihr Überleben zu sichern. Diese symbiotischen Beziehungen, wie die Raubtier-Beute-Beziehung, halten die Biosphäre am Laufen und verhindern das Aussterben von Arten. Dies bedeutet, dass sich eine Art in irgendeiner Weise auf die andere Art auswirkt, wenn sie sich entwickelt. Diese Koevolution der Spezies ist wie ein evolutionäres Wettrüsten, das darauf besteht, dass sich auch die anderen Spezies in der Beziehung weiterentwickeln müssen, um zu überleben.
Die Evolutionshypothese der „Roten Königin“ bezieht sich auf die Koevolution von Arten. Es besagt, dass sich die Arten kontinuierlich anpassen und weiterentwickeln müssen, um Gene an die nächste Generation weiterzugeben und um nicht auszusterben, wenn sich andere Arten innerhalb einer symbiotischen Beziehung weiterentwickeln. Dieser Teil der Hypothese, der erstmals 1973 von Leigh Van Valen vorgeschlagen wurde, ist besonders wichtig für eine Raubtier-Beute-Beziehung oder eine parasitäre Beziehung.
Nahrungsquellen sind wohl eine der wichtigsten Arten von Beziehungen im Hinblick auf das Überleben einer Art. Wenn sich zum Beispiel eine Beutetierart im Laufe der Zeit schneller entwickelt, muss sich das Raubtier anpassen und weiterentwickeln, um die Beute weiterhin als zuverlässige Nahrungsquelle zu nutzen. Andernfalls entkommt die jetzt schnellere Beute, und das Raubtier verliert eine Nahrungsquelle und ist möglicherweise ausgestorben. Wenn das Raubtier jedoch selbst schneller wird oder sich auf eine andere Weise entwickelt, als wenn es verstohlener oder besserer Jäger wird, kann die Beziehung fortgesetzt werden, und die Raubtiere werden überleben. Nach der Hypothese der Roten Königin ist dieses Hin- und Herbewegen der Spezies eine ständige Veränderung, wobei sich über lange Zeiträume kleinere Anpassungen ansammeln.
Ein weiterer Teil der Red Queen-Hypothese betrifft die sexuelle Selektion. Es bezieht sich auf den ersten Teil der Hypothese als Mechanismus zur Beschleunigung der Evolution mit den gewünschten Merkmalen. Arten, die in der Lage sind, einen Partner auszuwählen, anstatt sich einer asexuellen Fortpflanzung zu unterziehen, oder die nicht in der Lage sind, einen Partner auszuwählen, können Merkmale in diesem Partner identifizieren, die wünschenswert sind und die geeigneteren Nachkommen für die Umwelt hervorbringen. Hoffentlich führt diese Mischung wünschenswerter Merkmale dazu, dass die Nachkommen durch natürliche Selektion ausgewählt werden und die Art weiter besteht. Dies ist ein besonders nützlicher Mechanismus für eine Art in einer symbiotischen Beziehung, wenn die andere Art keine sexuelle Selektion durchlaufen kann.
Ein Beispiel für diese Art der Interaktion wäre eine Beziehung zwischen Wirt und Parasit. Personen, die sich in einem Gebiet mit zahlreichen parasitären Beziehungen paaren möchten, halten möglicherweise Ausschau nach einem Partner, der gegen den Parasiten immun zu sein scheint. Da die meisten Parasiten ungeschlechtlich sind oder nicht in der Lage sind, sich einer sexuellen Selektion zu unterziehen, hat die Spezies, die einen Immunpartner auswählen kann, einen evolutionären Vorteil. Das Ziel wäre es, Nachkommen zu produzieren, die die Eigenschaft haben, dass sie immun gegen den Parasiten sind. Dies würde die Nachkommen umweltfreundlicher machen und die Wahrscheinlichkeit erhöhen, dass sie lange genug leben, um sich selbst zu reproduzieren und die Gene weiterzugeben.
Diese Hypothese bedeutet nicht, dass der Parasit in diesem Beispiel nicht in der Lage wäre, sich gemeinsam zu entwickeln. Es gibt mehr Möglichkeiten, Anpassungen zu akkumulieren als nur die sexuelle Auswahl von Partnern. DNA-Mutationen können auch nur zufällig zu einer Veränderung des Genpools führen. Alle Organismen können unabhängig von ihrem Fortpflanzungsstil jederzeit Mutationen aufweisen. Dadurch können sich alle Arten, auch Parasiten, gemeinsam entwickeln, während sich auch die anderen Arten in ihren symbiotischen Beziehungen entwickeln.